1、藻相单一。由于藻类的生理习性，单一的藻相会导致光合作用非常强烈，从而使得养殖水体pH值持续偏高。例如硅藻、绿藻是我们喜欢的藻类，但在养殖前期，都容易引发单一藻相水质pH值的升高。
2、有害藻类。如蓝藻、甲藻或隐藻的过度繁殖(水色呈蓝绿或红褐色)，会引起养殖水体pH值变化较大(白天很高，夜晚偏低)。
3、水草问题。水草大量繁殖，也会因光合作用强烈，产生富余游离氧，导致养殖水体pH急剧升高。
4、天气变化。降温，比如立秋以后、或秋冬交际，养殖水体中藻相会从绿藻、蓝藻慢慢转变为硅藻、金藻、甲藻。这种藻相变化，也会导致养殖水体pH值逐步偏高。
1、营养丰富；几乎不能活动的漂浮性便于幼苗摄食；光合作用能力强大，产氧量大；吸收毒素有机物，氮源污染快速等。
2、硅藻分布于几乎所有的水体，甚至其它藻类难以繁生的河流中也有硅藻种类。硅藻是大多数水产动物的开口饵料（牡蛎、蛏、蛤、蚶的饵料以硅藻占首；海洋浮游甲壳动物、鲱鱼、沙丁鱼等的幼体也以硅藻为主食；中国毛虾尤喜摄食星脐圆筛藻），所以大多数水产养殖品种的苗期都以培养硅藻为最佳的藻相选择。
3、硅藻偏重，容易在池底死亡，加上硅藻能大量吸收水体有机质，一旦死亡数量过大，细胞内的有机质被短时间释放出来，对池底水体都是不小的污染。而且这个变化和污染是隐性的，是从池底往上蔓延开来的。所以一旦硅藻水倒藻，带来的都是整个池塘的泛塘和毁灭。这一点对于水产养殖而言非常危险。所以，养殖中后期遇到硅藻水要特别注意改底和保藻培菌，为的就是及时分解死亡的硅藻和保证池底溶氧充足。不至于短时间全军覆没。
4、另外，一些硅藻（如骨条藻、菱形藻、盒形藻、角毛藻、根管藻、海链藻等）一旦营养和气候条件适宜就可快速形成赤潮。甚至有些硅藻（如根管藻）密集在一起，可阻碍或改变鱼类（如鲱鱼）的洄游路线，降低渔获量。
5、这些都说明硅藻繁殖速度非常快，极易形成水体种群优势，这一点上，近几年有人在试着用定向培养硅藻的方法来防治蓝藻、甲藻等有害藻类，在特定条件满足（具备气氧）时确实有一定的功效。
夏季气温高，天气变化频繁，会突然的出现降温或暴雨，导致水环境发生剧烈的变化，水温波动大，就容易发生倒藻的情况。
肥水过度，换水添水后没有及时追肥等都会造成微生物失衡，从而引发倒藻。另外，过量使用含氯消毒剂、杀藻杀草剂、杀虫剂、重金属盐类等也会造成转水倒藻。
池塘藻类过于单一，其他藻类繁殖速度慢，藻类老化死亡后，其他藻类无法及时补充，一旦占优势种群的藻类生长达到顶峰便会老化死亡，造成倒藻
对于池塘来说，轮虫以藻类为食，如果轮虫大量繁殖，会摄食大量的藻类，造成藻类缺乏，引起倒藻。
藻类在夜间也是需要呼吸的，呼吸时需要消耗大量的氧气，因此在天气变化时增大池塘底部氧气含量，不仅可以预防养殖动物缺氧，还能给藻类提供氧气，防止倒藻。
水体菌藻平衡可以维持水体良好的环境，定期使用芽孢杆菌（水净灵）可以分解有机质提供藻类吸收的营养，藻类光合作用产生氧气促进菌类繁殖，提高藻类的新陈代谢以及抗逆能力。
定期使用藻益生+E能净，补充有益藻，以及补充藻种所需的营养，包括氨基酸、矿物质，促进藻类新陈代谢。
定期往水体中泼洒白云石粉或者小苏打，增加水体的缓冲能力，可以减少池塘PH变化，增加水体的稳定性。
