扁竹兰地上茎比鸢尾要细小一些，颜色也更深一些，还有它们的叶子都为宽剑形，但是扁จ竹兰的叶子更大更宽，扁竹兰的茎秆细小直立，鸢尾略粗而弯曲，鸢尾花为蓝紫色，比扁竹兰的蓝白色小花大得多，它们结出的果实也不相同。
1、根茎不同
鸢尾
鸢尾的的根茎从地底长出，斜向生长，直径在1cm左右，略粗，叶子在斜生茎上长出，扁竹兰的根茎自地ฉ面匍匐生长，有很多节部，节部上有须根和分枝，根茎呈黄褐色，比起鸢尾的根茎要细小一些，直径只有5mm左右。
2、叶子不同
鸢尾
鸢尾的叶子从根茎上长出，没有叶柄，叶子呈宽剑状，中间较宽，叶尖和叶。子基部汇集成尖状，中间最宽部分约3cm，扁竹兰的叶子基部十分密集，聚集在茎秆顶端，如伞状展开，叶片也是宽剑形，但是比鸢尾叶子要宽得多。
3、茎秆不同
扁竹兰
在扁竹兰和鸢尾的区别中，扁竹兰的茎秆从根茎上分生出来，向上生长，和根茎一样十分细小，具有较长的节部，茎秆较直，鸢尾的茎秆从根茎上斜伸出，弯曲在地面生长，和根茎相似，茎顶端有1～2个侧枝。
4、花朵不同
扁竹兰
鸢尾的花生于花茎顶端，花为蓝紫色，中间有部分❤白色，花茎较短，一朵花有内外两层，外层花边缘波浪状，内¡花多为白色，扁竹兰的花色为浅蓝色、白色，花瓣边缘褶皱，不是鸢尾那般明显波浪。
5、果实不同
鸢尾的果实为长椭圆形和倒卵形，果实长5cm左右，宽2cm左右，成熟之后会自己裂开，露出黑色的种子，扁竹兰的果实也是椭圆形，长约3cm宽1cm左右，比鸢尾果实小很多，表面有网状的脉络，种子为黑褐色。
