形态结构屏障
有些植物表面有蜡质、绒毛，阻止病原菌到达角质层。有的植物具有坚厚的角质层，能阻止病原菌侵入植物组织。植物受到病原物侵染后，细胞壁木质化，富含羟ห脯氨酸的蛋白质含量增加，阻碍有害物质积累。植物体受到病原物侵染后，发生局部组织ฎ坏死，使依赖活细胞生存的病原菌无法存活。
内源抗病物质
植物凝集素专一性识别病菌细胞壁中的糖蛋白，并将病原物凝集在一起；同时具有外源抗体的作用，杀死病原菌。
酚类化合物植物体内绿原酸、单宁酸、儿茶酚、原儿茶酚等酚类物质对病原菌具有一定毒性，当植物体感病受伤后，这些酚类化合物在多酚氧化酶和过氧化酶催化下，氧化成毒性更强的醌类物质，抑制病原菌磷酸化酶、纤维素酶活性。
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植保素植保素的诱导生成是非专一性的，在受侵染的细胞周围积累，起屏障作用，迄今已在17科植物中发现了200多种植保素，包括酚类物质（如绿原酸、♀香豆酸）、异黄酮类物质（如豌豆素、菜豆素）和萜类物质等。
水解病原菌细胞壁植物体内的几웃丁酶和β1，3葡聚糖酶能水解病原菌的细胞壁。
